射水神社の御祭神は瓊瓊杵尊（ににぎのみこと）です。古来は霊山である二上山をお祀りしており、「二上神」、「二上大権現」として崇められてきましたが、明治時代の神仏分離令により二上神は瓊瓊杵尊として祀られるようになりました。現在の本殿は1902年に造営されたもので、伊勢神宮に準ずる神明造といわれる造りが特徴的です。

　ご祈祷は9:00~16:30の時間で、授与所にある御祈願受付にてお申し込みができます。個人は予約不要、団体の場合は事前予約が必要です。願意は瓊瓊杵尊のご神徳である五穀豊穣、商業繁栄、縁結び等をはじめ各種あります。なお行事等によりご祈祷が受付できない場合もあります。