御祭神は総称して石上大神（いそのかみのおおかみ）と呼ばれ、その主祭神は拝殿裏の御本地（ごほんち）と呼ばれる禁足地に祀られています。日本最古の神社のひとつといわれており、古くから健康長寿、病気平癒、除災招福、百事成就の神様として信仰されてきました。

　ご祈祷は受付時間8:00~17:00（冬季は~16:30）で、楼門横の「ご祈祷受付所」で毎日受け付けられています。申込用紙に願意や氏名などを記入のうえ、お申込みください。時間外で希望される場合は、お問い合わせ次第で調整可能です。申込は郵送でも可能で、ウェブサイトから申込用紙pdfをダウンロードできます。主な願意は家内安全、商売繁昌、社運隆昌、各種人生儀礼などがあります。