主祭神は瓊瓊杵命（ににぎのみこと）、武甕槌命（たけみかづちのみこと）の二柱です。本殿は標高567mを誇る真山の山頂にあり、国家安泰、武運長久、五穀豊穣、海上安全の守護神として崇敬されています。２階からは眺望も良いそうです。

　ご祈祷は電話による事前の問合せと予約が必要です。受付時間は9:00～16:30で、願意は家内安全、商売繁盛、学業成就、厄難消除、厄年祓などです。

　また近隣にある男鹿水族館GAOでは、真山神社でのご祈祷を経て、難しいといわれるホッキョクグマの繁殖に成功しました。この経緯から、真山神社には恋愛成就、夫婦円満、子宝、安産などを願う人も多く訪れています。